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南京烟囱废气在线监测系统解决方案应包括：

1. 采样准备和过程控制：采样过程应符合烟囱废气质量的采样规范，采用自动气动和设备控制采样系统，实现自动无人值守的采样，使采样持续、准确可靠；

2. 分析检测技术：采用分析仪表测量，可以实时在线分析、检测烟囱废气中的温度、湿度等状态参数及污染物，具有高灵敏度、低误差以及可靠的测量精度；

3. 噪声控制：采用噪声消除技术，能够有效抑制噪声，让烟囱废气的检测结果更加准确；

4. 信息自动采集和发送：采集系统应该实时监测、采集烟囱废气质量数据并自动存储，通过网络或GPRS无线通讯发送给监管部门；

5. 数据信息管理与数据分析技术：利用计算机处理、存储及传送烟囱废气质量数据，以及建立数据库，实现及时数据记录到数据库，方便分析监测数据的解读、和数据分析。